¿Qué significa SAR?
Significa “Relación estructura-actividad”, y estudia cómo las modificaciones químicas en una molécula afectan su actividad biológica.
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| Term | Definition |
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| ¿Qué significa SAR? | Significa “Relación estructura-actividad”, y estudia cómo las modificaciones químicas en una molécula afectan su actividad biológica. |
| ¿Para qué sirve el análisis SAR? | Sirve para identificar qué grupos químicos o partes de la molécula son responsables de su actividad biológica. |
| ¿Quién propuso por primera vez relaciones entre estructura química y acción fisiológica? | Crum-Brown y Fraser en 1868. |
| ¿Qué permite el estudio SAR en un compuesto? | Determinar la importancia de los elementos estructurales involucrados en la actividad biológica. |
| ¿Qué herramientas se usan en modelación molecular SAR? | Análisis conformacional, mecánica cuántica, campos de fuerzas y gráficos moleculares interactivos. |
| ¿Qué significa QSAR? | Relaciones Cuantitativas Estructura-Actividad (Quantitative Structure-Activity Relationships). |
| ¿Quién introdujo los métodos QSAR? | Hansch y Fujita en la década de 1960. |
| ¿Qué busca el enfoque QSAR? | Desarrollar una relación matemática entre las propiedades fisicoquímicas y la actividad biológica de un fármaco. |
| ¿Cuál es el objetivo general de QSAR? | Encontrar parámetros que, al sustituirse en una ecuación, correlacionen con la actividad biológica de una serie de moléculas. |
| ¿Qué propiedades puede predecir QSAR además de la bioactividad? | Solubilidad, punto de fusión, pKa, absorción, metabolismo, excreción y toxicidad. |
| Menciona tres objetivos del QSAR. | 1) Correlacionar cambios químicos con la actividad biológica, 2) Optimizar compuestos líderes, 3) Predecir la actividad de compuestos no probados. |
| ¿Cuáles son las etapas del método QSAR? | Planteamiento de objetivos, determinación de la actividad, descripción de compuestos, análisis estadístico, interpretación y predicción. |
| ¿Qué es un descriptor molecular? | Una variable numérica que refleja aspectos estructurales de una molécula. |
| ¿Qué tipos de descriptores existen según su dependencia espacial? | Descriptores independientes y dependientes de la conformación espacial. |
| ¿Qué son los descriptores OD (0D)? | Descriptores constitucionales basados en la fórmula molecular, como peso molecular o número de átomos. |
| ¿Qué describen los descriptores 1D? | Fragmentos estructurales y propiedades como parámetros hidrofóbicos o refractividad molar. |
| ¿Qué representan los descriptores 2D? | La topología molecular o la conectividad entre los átomos. |
| ¿Qué consideran los descriptores 3D? | La configuración y conformación espacial tridimensional de la molécula. |
| ¿Qué incluye un descriptor 4D? | Información sobre múltiples conformaciones posibles (espacio conformacional). |
| ¿Qué propiedades se analizan en QSAR? | Biológicas (ICBD, MIC, LD), intrínsecas (PM, volumen, área), y fisicoquímicas (estéricas, electrónicas, lipofílicas, enlaces H). |
| ¿Cuál es el flujo de trabajo general en QSAR? | Reunir datos, calcular descriptores, seleccionar variables relevantes, construir modelo, validar y evaluar dominio de aplicabilidad. |
| ¿Qué modelo propuso Hansch para QSAR? | log(1/C) = k1(partición) + k2(electrónico) + k3(estérico) + k4 |
| ¿Qué representa “C” en la ecuación de Hansch? | La concentración mínima necesaria para provocar una respuesta biológica. |
| ¿Cuáles son las limitaciones del análisis de Hansch? | Requiere muchos compuestos, es una técnica de optimización y no estudia interacciones fármaco-receptor. |
| ¿En qué consiste el método de Free-Wilson? | Relaciona la actividad biológica con la presencia o ausencia de grupos funcionales en posiciones específicas. |
| ¿Cuál es la ventaja principal del método de Free-Wilson? | Es simple, rápido, no requiere constantes fisicoquímicas y permite identificar contribuciones de cada sustituyente. |
| ¿Cuál es su principal desventaja? | Requiere muchos análogos y no explica por qué un sustituyente mejora o reduce la actividad. |
| ¿Qué significa COMFA? | Comparative Molecular Field Analysis, un método QSAR 3D basado en campos moleculares comparativos. |
| ¿Qué método estadístico se usa en COMFA? | Análisis multivariante de mínimos cuadrados parciales (PLS). |
| ¿Qué diferencia hay entre PCA y MLR en QSAR? | PCA analiza múltiples propiedades simultáneamente, mientras que MLR solo correlaciona unas pocas. |
| ¿Qué ventaja tiene el método PLS sobre PCA? | Modela múltiples parámetros dependientes y maximiza la correlación entre variables. |
| ¿Qué se debe cuidar al validar un modelo QSAR? | Selección adecuada de variables, significancia estadística y validación cruzada con suficientes compuestos. |
| ¿Cómo se clasifican los métodos QSAR según su dimensionalidad? | 1D, 2D, 3D, 4D, 5D y 6D. |
| ¿Qué analiza el QSAR 1D? | Propiedades globales como pKa o logP. |
| ¿Qué analiza el QSAR 2D? | Patrones estructurales sin representaciones tridimensionales. |
| ¿Qué analiza el QSAR 3D? | Campos de interacción no covalente alrededor de las moléculas. |
| ¿Qué incorpora el QSAR 4D? | Libertad conformacional y de alineamiento molecular. |
| ¿Qué evalúa el QSAR 5D? | Varios protocolos de ajuste inducido simultáneamente. |
| ¿Qué considera el QSAR 6D? | Diferentes modelos de solvatación. |
| ¿Qué es el docking molecular? | Técnica para cuantificar la interacción entre un fármaco y una proteína calculando su energía de interacción. |
| ¿Qué determina el docking? | La conformación con menor energía, que indica el modo más estable de unión. |
| ¿Cuáles son las ventajas del QSAR? | Cuantificar la relación estructura-actividad, predecir nuevas moléculas y apoyar la comprensión del mecanismo de acción. |
| ¿Cuáles son las desventajas del QSAR? | Posibles correlaciones falsas, datos experimentales limitados y riesgo de sobreajuste (overfitting). |
| Menciona tres aplicaciones del QSAR. | Priorización de fármacos, reducción de pruebas con animales, predicción de propiedades. |
| ¿Cuál es la regla de los cinco de Lipinski? | Un fármaco oralmente activo debe tener PM < 500, logP < 5, ≤5 donadores H y ≤10 aceptores H. |
| ¿Qué indica un valor bajo de logP según Lipinski? | Alta hidrofobicidad que favorece la absorción oral. |
| ¿Qué aportó el análisis SAR a la química medicinal? | Ayudó a modificar estructuras para aumentar potencia, selectividad y reducir toxicidad. |
| ¿Qué papel tiene el QSAR en el diseño racional de fármacos? | Permite predecir la bioactividad y guiar el diseño antes de la síntesis experimental. |
| ¿Qué representa el análisis SAR basado en el receptor? | Representa cómo los cambios en la estructura del receptor afectan la interacción con los ligandos. |
| ¿Qué representa el análisis SAR basado en el ligando? | Representa cómo los cambios estructurales del ligando modifican su afinidad o actividad sobre el receptor. |
| ¿Por qué es importante alterar la estructura molecular en SAR? | Permite determinar la importancia de grupos funcionales o sustituyentes específicos en la actividad. |
| ¿Qué requiere un estudio SAR confiable? | La síntesis de varios análogos y la determinación de su actividad biológica. |
| ¿Qué tipo de análisis se usa en SAR 3D? | Modelación molecular considerando las propiedades tridimensionales de las moléculas. |
| ¿Qué herramientas computacionales son clave en SAR y QSAR? | Mecánica cuántica, campos de fuerza y gráficos moleculares interactivos. |
| ¿En qué consiste el análisis de regresión lineal múltiple (MLR)? | Correlaciona la actividad biológica con variables fisicoquímicas mediante una ecuación lineal. |
| ¿Qué es el análisis de componentes principales (PCA)? | Método estadístico que reduce la dimensionalidad de los datos correlacionando muchas variables con la actividad biológica. |
| ¿Qué significa PLS en QSAR? | “Partial Least Squares” o mínimos cuadrados parciales; maximiza la correlación entre variables independientes y dependientes. |
| ¿Qué ventaja tiene PLS sobre otros métodos? | Puede modelar varios parámetros dependientes y manejar datos multivariantes complejos. |
| ¿Qué pasos implica la validación de modelos QSAR? | Validación interna (cruzada) y externa, análisis estadístico y evaluación del dominio de aplicabilidad. |
| ¿Qué significa el dominio de aplicabilidad de un modelo QSAR? | El rango químico en el que el modelo puede hacer predicciones confiables. |
| ¿Qué se debe evitar en QSAR para mantener la validez del modelo? | El sobreajuste (overfitting) por exceso de variables o datos no representativos. |
| ¿Qué tipo de datos se necesitan para desarrollar un modelo QSAR confiable? | Datos biológicos y fisicoquímicos de alta calidad y representativos del espacio químico de interés. |
| ¿Qué diferencia hay entre descriptores globales y locales? | Los globales describen la molécula completa; los locales describen partes o subestructuras. |
| ¿Qué tipo de propiedades pueden usar los descriptores químicos? | Propiedades experimentales, calculadas o combinadas. |
| ¿Cuáles son ejemplos de propiedades biológicas usadas en QSAR? | IC₅₀, MIC, LD₅₀. |
| ¿Cuáles son ejemplos de propiedades intrínsecas usadas en QSAR? | Peso molecular, volumen y área superficial. |
| ¿Cuáles son ejemplos de propiedades fisicoquímicas usadas en QSAR? | Estéricas, electrónicas, lipofílicas y capacidad de formar enlaces de hidrógeno. |
| ¿Qué método QSAR permite incorporar múltiples conformaciones de una molécula? | QSAR 4D. |
| ¿Qué método QSAR considera diferentes protocolos de ajuste inducido? | QSAR 5D. |
| ¿Qué método QSAR considera distintos modelos de solvatación? | QSAR 6D. |
| ¿Qué diferencia hay entre COMFA y COMSIA? | COMFA analiza campos moleculares electrostáticos y estéricos; COMSIA incluye además campos de hidrofobicidad y enlaces de hidrógeno. |
| ¿Qué mide el COMFA? | La correlación entre la actividad biológica y los campos de interacción tridimensional de las moléculas. |
| ¿Qué hace el análisis PLS en COMFA? | Aplica mínimos cuadrados parciales para correlacionar campos moleculares con la actividad observada. |
| ¿Por qué se considera QSAR una técnica potente en cribado virtual (VS)? | Porque tiene alto rendimiento, rapidez y una buena tasa de predicción. |
| ¿Por qué es importante la validación experimental de QSAR? | Porque las predicciones computacionales deben confirmarse con resultados biológicos reales. |
| ¿Qué papel tiene el docking en QSAR 3D? | Permite determinar la orientación del ligando en el receptor y calcular energías de unión. |
| ¿Cómo se selecciona la mejor conformación en docking molecular? | Se elige la que presenta la menor energía de interacción entre el fármaco y el receptor. |
| ¿Cuál es la principal utilidad del docking molecular? | Guiar el diseño de compuestos con mejor afinidad hacia su diana biológica. |
| ¿Qué beneficio tiene QSAR en el diseño de fármacos? | Reduce tiempo y costos al permitir predicciones previas a la síntesis. |
| ¿Por qué QSAR ayuda a reducir el uso de animales en experimentación? | Porque permite estimar la toxicidad o bioactividad sin pruebas in vivo iniciales. |
| ¿Cuál es el riesgo principal del uso de QSAR sin buena base de datos? | Obtener correlaciones falsas o modelos poco predictivos. |
| ¿Qué sugiere una buena correlación QSAR? | Que los descriptores seleccionados explican correctamente la actividad observada. |
| ¿Qué permite diagnosticar una ecuación QSAR? | Posibles mecanismos de acción o grupos funcionales importantes en la actividad. |
| ¿Qué demuestra la regla de Lipinski sobre la absorción oral? | Que existen límites fisicoquímicos para que un fármaco sea absorbido eficazmente por vía oral. |
| ¿Cuántos donadores de puentes de hidrógeno puede tener un fármaco oral según Lipinski? | Hasta cinco. |
| ¿Cuántos aceptores de puentes de hidrógeno puede tener un fármaco oral según Lipinski? | Hasta diez. |
| ¿Cuál es el valor máximo de logP recomendado por Lipinski? | Menor de 5. |
| ¿Qué valor máximo debe tener el peso molecular según la regla de Lipinski? | Menor de 500. |
| ¿Qué ventaja ofrece QSAR frente a ensayos experimentales tradicionales? | Permite priorizar y optimizar moléculas antes de su síntesis, reduciendo costos y tiempo. |
| ¿Qué puede causar el sobreajuste en un modelo QSAR? | Usar demasiadas variables o datos no representativos del fenómeno biológico. |
| ¿Qué parámetro mide la lipofilicidad en modelos QSAR? | LogP. |
| ¿Qué propiedad describe la refractividad molar? | La polarizabilidad y el volumen efectivo de una molécula. |
| ¿Cuáles son los dos pasos fundamentales propuestos por Hansch en la acción de un fármaco? | 1) Transporte al sitio de acción, 2) Unión al blanco terapéutico. |
| ¿Qué tipo de análisis puede establecer QSAR? | Análisis de regresión o clasificación estadística de tendencias. |
| ¿Qué determina la importancia de los elementos estructurales en SAR? | La comparación de las actividades biológicas tras modificaciones moleculares. |
| ¿Qué debe corroborar todo modelo QSAR según las recomendaciones de validación? | Su relevancia con datos biofísicos conocidos. |